A de Habitat

All materials on our website are shared by users. If you have any questions about copyright issues, please report us to resolve them. We are always happy to assist you.
 19 views
of 231

Please download to get full document.

View again

Description
Package ‘adehabitat’ August 29, 2013 Version 1.8.12 Date 2013/01/11 Title Analysis of habitat selection by animals Author Clement Calenge, contributions from Mathieu Basille, Stephane Dray and Scott Fortmann-Roe Maintainer Clement Calenge Depends R ( = 2.10.0), ade4, tkrplot, shapefiles Suggests gpclib, sp, spatstat, MASS, CircStats Description A collection of tools for the analysis of habitat selection by animals License GPL ( = 2) URL http://www.faunalia.it/anim
Share
Tags
Transcript
  Package ‘adehabitat’ August 29, 2013 Version 1.8.12 Date 2013/01/11 Title Analysis of habitat selection by animals Author Clement Calenge, contributions from Mathieu Basille, Stephane Dray and Scott Fortmann-Roe Maintainer Clement Calenge <clement.calenge@oncfs.gouv.fr> Depends R (>= 2.10.0), ade4, tkrplot, shapefiles Suggests gpclib, sp, spatstat, MASS, CircStats Description A collection of tools for the analysis of habitat selection by animals License GPL (>= 2) URL http://www.faunalia.it/animove/trac/  Repository CRAN Date/Publication 2013-01-11 16:23:51 NeedsCompilation yes R topics documented: adehabitat-package . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .4albatross . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .6angles . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .7area2asc . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .9area2dxf . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .10as.area . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .11as.kasc . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .12as.ltraj . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .14as.sahrlocs . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .19as.traj . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .21asc2im . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .231  2 R topics documented: ascgen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .24bauges . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .25bear . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .26bighorn . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .26biv.test . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .27buffer . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .29burst . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .30c.ltraj . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .32capreochiz . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .33capreotf . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .33chamois . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .34Chi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .34clusthr . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .36colasc . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .38compana . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .39convnum . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .43count.points.id . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .44cutltraj . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .46distfacmap . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .48domain . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .49dunnfa . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .50eisera . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .53enfa . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .56engen2008II . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .59explore.kasc . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .66Extract.ltraj . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .67findmaxasc . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .68fpt . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .69gdltraj . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .71getascattr . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .72getcontour . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .74getXYcoords . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .75gnesfa . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .76hbrown . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .82hist.kasc . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .83hist.ltraj . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .84histniche . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .85hr.rast . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .86hseal . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .87ibex . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .88ibexraw . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .88image.asc . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .89image.sahrlocs . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .90import.asc . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .92indmove . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .94is.regular . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .97is.sd . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .98 join.asc . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .100  R topics documented: 3kasc2df . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .101kasc2spixdf . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .102kernelbb . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .106kernelkc . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .111kerneloverlap . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .120kernelUD . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .122kselect . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .128kver . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .131labcon . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .133lowres . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .134lynxjura . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .135madifa . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .135mahasuhab . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .140managNAkasc . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .142mcp . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .143mcp.rast . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .145mindistkeep . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .146modpartltraj . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .147morphology . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .151mouflon . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .153niche.test . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .153NNCH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .155NNCH.area . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .157NNCH.select . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .159offsetdate . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .162perarea . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .163pheasant . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .164plot.area . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .165plot.ltraj . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .166plot.sahrlocs . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .167plotltr . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .169porpoise . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .170predict.enfa . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .171puech . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .172puechabon . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .173puechcirc . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .174puechdesIII . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .174qqchi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .175rand.kselect . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .177randtest.enfa . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .179redisltraj . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .180runsNAltraj . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .181rupicabau . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .183sahrlocs2kselect . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .183sahrlocs2niche . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .184scatter.enfa . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .186scatterniche . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .188schoener . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .189  4 adehabitat-package  set.limits . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .191setmask . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .193setNA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .194sett0 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .196simm.bb . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .198simm.brown . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .199simm.crw . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .201simm.levy . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .202simm.mba . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .204simm.mou . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .205sliwinltr . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .207speed . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .208squirrel . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .210squirreloc . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .210storemapattr . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .211subsample . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .212subsetmap . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .213teal . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .215trajdyn . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .216typeII2typeI . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .217vanoise . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .218wawotest . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .218whale . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .219which.ltraj . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .220wi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .221 Index226 adehabitat-package adehabitat: a Package for the Analysis of the Space Use by Animals Description The package adehabitat has been designed to allow the analysis of the space use by animals.This package is organised in four main parts: (i) management of raster maps, (ii) habitat selec-tion/ecological niche analysis, (iii) home range estimation and (iv) analysis of animals trajectories.These four parts interact with each other to facilitate the analysis. Note that adehabitat stronglyrelies on the package ade4, which provides numerous functions for the analysis of multivariatedata. Details Package: adehabitatType: PackageVersion: 1.8.3Date: 2009-05-04License: GPL version 2 or newer
Related Search
We Need Your Support
Thank you for visiting our website and your interest in our free products and services. We are nonprofit website to share and download documents. To the running of this website, we need your help to support us.

Thanks to everyone for your continued support.

No, Thanks
Find Mirrors | डाउनलोड APK | épisode 1 streaming